La historia se desarrolla en un Neo-Tokyo postapocalíptico. Kaneda, un joven pandillero, se ve envuelto en un conflicto que involucra a su amigo Tetsuo, quien desarrolla habilidades psíquicas después de un encuentro con un misterioso niño llamado Akira. A medida que Tetsuo pierde el control de sus poderes, desencadenando el caos, se revelan secretos oscuros del pasado. La trama aborda temas de poder, corrupción y la naturaleza destructiva de la ciencia y la tecnología.